Plateforme métabolomique

La plateforme métabolomique procède à des analyses de métabolomique et de lipidomique, en ciblé et non ciblé, en spectrométrie de masse couplée à la chromatographie gazeuse ou liquide (GC-MS, LC-MS/MS).

Nous offrons nos services tant à la communauté universitaire qu’à l’industrie. Nous pouvons vous accompagner dans vos projets de recherche dès leur mise en œuvre incluant le devis expérimental, la préparation des échantillons, l’analyse et l’interprétation des résultats afin d’assurer le succès de votre étude et de soutirer le maximum de nouvelles informations biologiques. Différentes classes de métabolites peuvent être investiguées de manière quantitative, semi-quantitative ou relative selon le type d’analyse. Dans le cas de la lipidomique, l’annotation des lipides d’intérêt avec leurs chaînes acyles et leur position (sn) peut être effectuée par MS/MS.

Les matrices validées et analysées jusqu’à présent incluent chez l’humain et/ou la souris : plasma, sérum, globules rouges, mitochondries, cellules, lipoprotéines isolées, gouttelettes lipidiques, perfusat, lait maternel, tissus (cœur, foie, muscle, cerveau, placenta, rein, tissus adipeux, îlots pancréatiques, moelle épinière). Nous pouvons aussi faire d’autres espèces comme par exemple : C. elegans ou bactéries. Pour toute nouvelle matrice, nous pouvons appliquer toutes nos méthodes d’analyse après avoir procédé à des tests de faisabilité.

Nous sommes également familiers avec d’autres types d’analyses incluant 1) le phénotypage métabolique et fonctionnel du cœur de souris (et de rat) par le biais de sa perfusion ex vivo en mode travaillant en présence de substrats marqués au carbone 13 ainsi que 2) l’analyse de flux métaboliques basée sur l’utilisation des substrats avec des isotopes stables.

Directrice de la plateforme

• Christine Des Rosiers

Co-directeur de la plateforme

• Matthieu Ruiz

Assistants de recherche

• Bertrand Bouchard, M.Sc. microbiologie (27 années d’expérience) : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS & LC-MS/MS), incluant la préparation/analyse d’échantillons.
  Courriel : bertrand.bouchard@mhi-rc.org
• Anik Forest, M.Sc. physique et chimie (24 années d’expérience) : Expertise en spectrométrie de masse (LC-MS/MS) et analyse des résultats (« data mining »).
  Courriel : anik.forest@mhi-rc.org
• Isabelle Robillard Frayne, M.Sc. chimie (17 années d’expérience) : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS & LC-MS/MS), préparation/analyse d’échantillons, des données et des résultats.
  Courriel : isabelle.robillard@mhi-rc.org
• Caroline Daneault, M.Sc. biochimie (13 années d’expérience) : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS & LC-MS/MS), préparation/analyse d’échantillons, des données et des résultats.
  Courriel : caroline.daneault@icm-mhi.org
• Julie Thompson Legault, M.Sc. nutrition (10 années d’expérience) : Expertise en métabolomique et coordination d’étude clinique.
  Courriel : julie.thompson@mhi-rc.org