Métabolomique

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Principaux thèmes recherche de recherche du laboratoire dirigé par Dr Christine Des Rosiers :

Facteurs impliqués dans le développement et la progression de la maladie cardiaque: Rôle des anomalies métaboliques et leur modulation par les agents pharmacologiques ou par la diète.
Découverte de nouveaux biomarqueurs par le biais de la métabolomique : Maladies cardiovasculaires, mitochondriales et inflammatoires.

Expertise du laboratoire :

Analyses métabolomiques, dont la lipidomique, ciblées et non ciblées par la spectrométrie de masse (chromatographie gazeuse et liquide : GC-MS, LC-MS/MS) appliquées à diverses classes de métabolites: phospholipides, cholestérol, sphingolipides, acylcarnitines, acides biliaires, acides gras, acides organiques et acides aminés.

Phénotypage métabolique et fonctionnel du coeur de souris par le biais de sa perfusion ex vivo en mode travaillant en présence de substrats marqués au carbone 13.
Investigations métaboliques: analyse de flux métaboliques basée sur l’utilisation des substrats avec des isotopes stables et la spectrométrie de masse.

Membres de l'équipe

Étudiants/stagiaires postdoctoraux:

Sandra Therrien, candidate M.Sc. Bioinformatique : Métabolomique et prédiction de la réponse aux médicaments en maladies inflammatoires de l'intestin : Développement d'un outil bioinformatique pour relier les gènes aux métabolites.

Yvette Mukaneza, candidate Ph.D. nutrition, co-direction avec le Dr Lise Coderre: Effet de la mutation LRPPRC sur l'activité de l'AMPK dans des fibroblastes de patients atteints du syndrome de Leigh, type canadien français.

Matthieu Ruiz, Ph.D., stagiaire postdoctoral, co-direction avec le Dr Bruce Allen: Potentiel effet cardioprotecteur d'une délétion de la MAPK MK2 dans le développement de la cardiomyopathie diabétique

Assistants & associés de recherche :

Bertrand Bouchard, M.Sc. microbiologie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS & LC-MS/MS), incluant la préparation d'échantillons; Courriel : bertrand.bouchard@mhi-rc.org

Lise Coderre, Ph.D. biologie moléculaire : Expertise en syndrome métabolique et diabète, signalisation moléculaire; Courriel : lise.coderre@umontreal.ca

Caroline Daneault, M.Sc. biochimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : caroline.daneault@icm-mhi.org

Anik Forest, M.Sc. physique et chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS/LC-MS/MS) et analyse des résultats ("data mining"); Courriel : anik.forest@mhi-rc.org

Isabelle Robillard Frayne, M.Sc. chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : isabelle.robillard-frayne@icm-mhi.org

Julie Thompson Legault, M.Sc.nutrition : Expertise en métabolomique et coordination d'étude clinique; Courriel : julie.thompson@mhi-rc.org
Projet(s) de recherche

Les principaux projets en cours sont subventionnés par des organismes avec comités de pairs, soit les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), Génome Canada/Québec, la Fondation canadienne pour l'innovation (FCI).

  1. “Metabolic investigations using mass isotopomer analysis: A paradigm for biomarker and therapy discovery.” IRSC (2010-2015); subvention de fonctionnement; rôle: Investigateur principal (IP) (2 co-applicants).
  2. « Emerging team in the Leigh Syndrome French Canadian Type (LSFC): Translating LSFC gene discovery into treatments for patients.” IRSC (2010-2015); Subvention d’équipe; rôle: Chef d’équipe (7 co-applicants).
  3. “IBD Genomic Medicine Consortium (iGenoMed): translating genetic discoveries into a personalized approach to treating inflammatory bowel diseases.” Genome Canada (2012-2016). Rôle : Co-applicant (IP : Drs J. Rioux et A. Bitton; 9 co-applicants); responsable du volet métabolomique.
  4. Discovery, development and validation of biomarkers and theragnostic approaches. FCI (2009-2014). Rôle: Co-applicant (IP: Dr JC Tardif; 3 co-applicants); responsable du volet métabolomique.
Publications

Pubmed : C. Des Rosiers

Prix et distinctions

Les étudiants du laboratoire sont souvent récompensés pour leurs présentations orales ou par affiche lors des Journées de la Recherche de l'Institut de Cardiologie de Montréal.

La plupart de nos étudiants sont également financés par des bourses octroyées par divers organismes.

Cécile Martel

2013 :  1er prix présentation par affiche niveau post-doctorat

2013-15 : Bourse post-doctorale FRQS

Yvette Mukanesa

2014-2015:  Bourse CORAMH

2013-2014:  Bourse doctorat de la faculté de médecine UdeM

2013-2014:  Bourse du département de nutrition UdeM

2011-2013: Bourse maîtrise de la faculté de médecine UdeM

Marie-Eve Rivard

2010: 1er prix présentation orale niveau maîtrise

Julie Thompson Legault

2012 : CORAMH

2011 et 2012 - Fondation Go (devenue fondation du Grand défi Pierre Lavoie)


2010-2012 - Bourse de maîtrise FRQS

Anciens étudiants :

Roselle Gélinas

2009-2011: Bourse Ph.D. IRSC

Dominic Lachance

2012 : 2e prix présentation par affiche niveau post-doctorat

2012-2014 : Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC)

2010-2012 : Bourse post-doctorale FRQS et Fondation des maladies du cœur du Canada (FMCC)

Benjamin Lauzier

2011-2012 : Bourse post-doctorale de la FMCC

Fanny Vaillant

2012 : 1er prix présentation orale niveau post-doctorat

2011: 1er prix de présentation d'un séminaire niveau post-doctorat
Contact

Bertrand Bouchard
Assistant de recherche
514 376-3330, poste 2133
bertrand.bouchard@mhi-rc.org

Membres de l'équipe

Étudiants/stagiaires postdoctoraux:

Sandra Therrien, candidate M.Sc. Bioinformatique : Métabolomique et prédiction de la réponse aux médicaments en maladies inflammatoires de l'intestin : Développement d'un outil bioinformatique pour relier les gènes aux métabolites.

Yvette Mukaneza, candidate Ph.D. nutrition, co-direction avec le Dr Lise Coderre: Effet de la mutation LRPPRC sur l'activité de l'AMPK dans des fibroblastes de patients atteints du syndrome de Leigh, type canadien français.

Matthieu Ruiz, Ph.D., stagiaire postdoctoral, co-direction avec le Dr Bruce Allen: Potentiel effet cardioprotecteur d'une délétion de la MAPK MK2 dans le développement de la cardiomyopathie diabétique

Assistants & associés de recherche :

Bertrand Bouchard, M.Sc. microbiologie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS & LC-MS/MS), incluant la préparation d'échantillons; Courriel : bertrand.bouchard@mhi-rc.org

Lise Coderre, Ph.D. biologie moléculaire : Expertise en syndrome métabolique et diabète, signalisation moléculaire; Courriel : lise.coderre@umontreal.ca

Caroline Daneault, M.Sc. biochimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : caroline.daneault@icm-mhi.org

Anik Forest, M.Sc. physique et chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS/LC-MS/MS) et analyse des résultats ("data mining"); Courriel : anik.forest@mhi-rc.org

Isabelle Robillard Frayne, M.Sc. chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : isabelle.robillard-frayne@icm-mhi.org

Julie Thompson Legault, M.Sc.nutrition : Expertise en métabolomique et coordination d'étude clinique; Courriel : julie.thompson@mhi-rc.org

Projet(s) de recherche

Les principaux projets en cours sont subventionnés par des organismes avec comités de pairs, soit les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), Génome Canada/Québec, la Fondation canadienne pour l'innovation (FCI).

  1. “Metabolic investigations using mass isotopomer analysis: A paradigm for biomarker and therapy discovery.” IRSC (2010-2015); subvention de fonctionnement; rôle: Investigateur principal (IP) (2 co-applicants).
  2. « Emerging team in the Leigh Syndrome French Canadian Type (LSFC): Translating LSFC gene discovery into treatments for patients.” IRSC (2010-2015); Subvention d’équipe; rôle: Chef d’équipe (7 co-applicants).
  3. “IBD Genomic Medicine Consortium (iGenoMed): translating genetic discoveries into a personalized approach to treating inflammatory bowel diseases.” Genome Canada (2012-2016). Rôle : Co-applicant (IP : Drs J. Rioux et A. Bitton; 9 co-applicants); responsable du volet métabolomique.
  4. Discovery, development and validation of biomarkers and theragnostic approaches. FCI (2009-2014). Rôle: Co-applicant (IP: Dr JC Tardif; 3 co-applicants); responsable du volet métabolomique.

Publications

Pubmed : C. Des Rosiers

Liens

Association de l'Acidose lactique

Integrative genomic medicine

Prix et distinctions

Les étudiants du laboratoire sont souvent récompensés pour leurs présentations orales ou par affiche lors des Journées de la Recherche de l'Institut de Cardiologie de Montréal.

La plupart de nos étudiants sont également financés par des bourses octroyées par divers organismes.

Cécile Martel

2013 :  1er prix présentation par affiche niveau post-doctorat

2013-15 : Bourse post-doctorale FRQS

Yvette Mukanesa

2014-2015:  Bourse CORAMH

2013-2014:  Bourse doctorat de la faculté de médecine UdeM

2013-2014:  Bourse du département de nutrition UdeM

2011-2013: Bourse maîtrise de la faculté de médecine UdeM

Marie-Eve Rivard

2010: 1er prix présentation orale niveau maîtrise

Julie Thompson Legault

2012 : CORAMH

2011 et 2012 - Fondation Go (devenue fondation du Grand défi Pierre Lavoie)


2010-2012 - Bourse de maîtrise FRQS

Anciens étudiants :

Roselle Gélinas

2009-2011: Bourse Ph.D. IRSC

Dominic Lachance

2012 : 2e prix présentation par affiche niveau post-doctorat

2012-2014 : Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC)

2010-2012 : Bourse post-doctorale FRQS et Fondation des maladies du cœur du Canada (FMCC)

Benjamin Lauzier

2011-2012 : Bourse post-doctorale de la FMCC

Fanny Vaillant

2012 : 1er prix présentation orale niveau post-doctorat

2011: 1er prix de présentation d'un séminaire niveau post-doctorat

Contact

Bertrand Bouchard
Assistant de recherche
514 376-3330, poste 2133
bertrand.bouchard@mhi-rc.org